init: 初始化 dpb 桃育种系统代码库

前后端 + 后端 FastAPI 全量源码、部署脚本与文档。

backend/sql/weld_pedigree_ablup.sql

@@ -0,0 +1,27 @@
+-- ============================================================
+-- 断链焊接：系谱锚点 + 遗传力落库
+-- 幂等：全部 IF NOT EXISTS。
+-- 1) bre_tree 加 母本 dam_id / 父本 sire_id（FK→bre_germplasm）
+--    —— A 矩阵的系谱锚点（单株为子代、种质为亲本）
+-- 2) 按杂交组合回填现有单株的 dam/sire（组合无亲本的保持 NULL → founder）
+-- 3) bre_prediction 加 遗传力 heritability（§3.12）
+-- 注：SQLAlchemy create_all 只建新表、不改已有表，故已有库需执行本脚本一次。
+-- ============================================================
+
+-- ── 1) bre_tree：母本/父本 ──────────────────────────────
+ALTER TABLE bre_tree ADD COLUMN IF NOT EXISTS dam_id INTEGER REFERENCES bre_germplasm(id) ON DELETE SET NULL;
+ALTER TABLE bre_tree ADD COLUMN IF NOT EXISTS sire_id INTEGER REFERENCES bre_germplasm(id) ON DELETE SET NULL;
+CREATE INDEX IF NOT EXISTS ix_bre_tree_dam ON bre_tree(dam_id);
+CREATE INDEX IF NOT EXISTS ix_bre_tree_sire ON bre_tree(sire_id);
+
+-- ── 2) 回填现有单株（组合 female/male 亲本 → 树 dam/sire）────
+-- 重复执行安全：再次回填与组合同步（覆盖早期手工/旧值）。
+UPDATE bre_tree t
+SET dam_id = c.female_parent_id,
+    sire_id = c.male_parent_id
+FROM bre_cross_combination c
+WHERE t.combination_id = c.id
+  AND t.is_deleted = false;
+
+-- ── 3) bre_prediction：遗传力 h² ─────────────────────────
+ALTER TABLE bre_prediction ADD COLUMN IF NOT EXISTS heritability NUMERIC;