41b83e3a645c78fa97c358fecd41e2228ae1827d
生产 123 万行表(9.8GB)跑批次1时磁盘满回滚(2026-08-10)。 根因二:① alembic 无 transaction_per_migration,批次1的 01+02+03 全在一个 事务,JSON→JSONB 重写空间不释放、与后续重写叠加;② 1421ea169bb6 循环逐个 ALTER 5 个日期字段 = 5 次整表重写,同一事务累积。 修复:alembic.ini 开启 transaction_per_migration(每迁移独立提交,前序空间 释放);1421ea169bb6 合并 5 列为单条 ALTER(一次重写)。 本地 DB 已在 head 不受影响,heads 仍单一头 55105f0bb1d7。
SciLit Oncology — 肿瘤科文献管理平台
快速启动
# 1. 启动所有服务
docker compose up -d
# 2. 初始化数据库(首次)
docker compose exec backend alembic upgrade head
# 3. 访问
# 前端: http://localhost:5173
# 后端 API: http://localhost:8000/docs
# MinIO 控制台: http://localhost:9001 (minioadmin/minioadmin)
项目结构
backend/
├── app/
│ ├── main.py # FastAPI 入口
│ ├── config.py # 配置
│ ├── db.py # 数据库连接
│ ├── core/ # 核心:安全、权限、多租户中间件
│ ├── models/ # SQLAlchemy 模型 (32 张表)
│ ├── schemas/ # Pydantic 请求/响应
│ ├── api/v1/ # REST API 端点
│ └── tasks/ # ARQ 异步任务 (PubMed 管道)
├── alembic/ # 数据库迁移
└── config/specialties/ # 科室配置 (oncology.yaml)
frontend/
├── src/
│ ├── views/public/ # 公开页面 (无需登录)
│ ├── views/auth/ # 登录/注册
│ ├── views/app/ # 已登录应用页面
│ ├── stores/ # Pinia 状态管理
│ ├── api/ # Axios 封装
│ └── router/ # Vue Router
docs/ # 完整设计文档 (9 份)
技术栈
- 后端: FastAPI + SQLAlchemy 2.0 (async) + PostgreSQL 16 + Redis + Elasticsearch
- 前端: Vue 3 + Naive UI + Pinia + Vite
- 任务队列: ARQ
- 文件存储: MinIO / S3
- 多租户: PostgreSQL RLS + ContextVar 双层隔离
文档
详细的产品规划、数据库设计、标签体系、数据管道、UI 设计见 docs/ 目录。
Languages
Python
69%
Vue
26%
TypeScript
2.8%
Shell
1.8%
PLpgSQL
0.2%
Other
0.1%