34047007@qq.com a37cc506fc
CI / backend (push) Canceled after 0s
CI / frontend (push) Canceled after 0s
fix: 第三轮PubMed搜索审计 — 14项修复(P0×5, P1×4, P3×5)
P0 (搜索结果错误):
- 门控补全 sb/stat/uid_terms + dep_from/dep_to
- [SB] 映射修复: medline→citation_status, pubmed→no-op
- 括号组内单否定词丢失 not_() 修复
- HomeView URL watch 补全 sort/field/retracted/negative
- HomeView→SearchView 日期精度保留(urlDateFrom/urlDateTo)

P1 (功能缺陷):
- [ALL] 字段标签注册(_FIELD_TAG_MAP + _ALL_FIELD_TAGS)
- 独立日期字段 "2024-01-01"[DP] 降级修复(_dispatch_term)
- 浮点日期范围交换(2026-01-01:2024-01-01 → 自动排序)
- page_size URL 恢复 + syncSearchToUrl 输出

P3 (健壮性):
- MeSH 展开 try/catch(expand_atm + _expand_mesh_tag_ids)
- sort/field/boolean 参数验证(field_validator)
- GET /search 查询长度限制(100词)
- query_expansion.py 中文正则同步 [一-鿿㐀-䶿豈-﫿]
- import_mesh_full entry_terms 统一小写(匹配 JSONB @> 精确比较)

测试: 127/127 搜索测试通过,前端构建无报错
2026-07-27 11:02:22 +08:00

SciLit Oncology — 肿瘤科文献管理平台

快速启动

# 1. 启动所有服务
docker compose up -d

# 2. 初始化数据库(首次)
docker compose exec backend alembic upgrade head

# 3. 访问
# 前端: http://localhost:5173
# 后端 API: http://localhost:8000/docs
# MinIO 控制台: http://localhost:9001 (minioadmin/minioadmin)

项目结构

backend/
├── app/
│   ├── main.py              # FastAPI 入口
│   ├── config.py            # 配置
│   ├── db.py                # 数据库连接
│   ├── core/                # 核心:安全、权限、多租户中间件
│   ├── models/              # SQLAlchemy 模型 (32 张表)
│   ├── schemas/             # Pydantic 请求/响应
│   ├── api/v1/              # REST API 端点
│   └── tasks/               # ARQ 异步任务 (PubMed 管道)
├── alembic/                 # 数据库迁移
└── config/specialties/      # 科室配置 (oncology.yaml)

frontend/
├── src/
│   ├── views/public/        # 公开页面 (无需登录)
│   ├── views/auth/          # 登录/注册
│   ├── views/app/           # 已登录应用页面
│   ├── stores/              # Pinia 状态管理
│   ├── api/                 # Axios 封装
│   └── router/              # Vue Router

docs/                        # 完整设计文档 (9 份)

技术栈

  • 后端: FastAPI + SQLAlchemy 2.0 (async) + PostgreSQL 16 + Redis + Elasticsearch
  • 前端: Vue 3 + Naive UI + Pinia + Vite
  • 任务队列: ARQ
  • 文件存储: MinIO / S3
  • 多租户: PostgreSQL RLS + ContextVar 双层隔离

文档

详细的产品规划、数据库设计、标签体系、数据管道、UI 设计见 docs/ 目录。

S
Description
SciLit Backend - Oncology Literature Platform
Readme
144 MiB
Languages
Python 69.4%
Vue 26.2%
TypeScript 2.8%
Shell 1.1%
PLpgSQL 0.2%
Other 0.2%