34047007@qq.com
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- count/主查询独立短预算，超时降级不再 500：count 超时返回 _COUNT_CAP(10 万+) 而非 0（修复"找到 0 条结果"、分页被隐藏），主查询超时降级空结果 - 年份筛选改用 pub_date 范围，主查询 ORDER BY pub_date DESC NULLS LAST, id DESC 走新索引 ix_gl_pub_date_sort（Index Scan，替代 Parallel Seq Scan + Sort，89.5 万行 40s→<0.2s） - affiliations_text 反规范化列 + gin_trgm 索引 + 触发器维护，替换 7 处 jsonb lateral EXISTS（病理查询慢 ~40x）；存量由 scripts/backfill_affiliations.py 分批后台回填 - ATM 门控 _has_structured_terms：结构化查询（含字段标签）的 plain 词不做 MeSH 展开， 修复 "lung neoplasms[MAJR]+年份" count 5s + main 6s 双超时（11.72s→2.02s） - query_expansion/mesh IN(subquery) 去显式 DISTINCT（百万级 id 集合物化排序） - alembic env 改 connect()（transaction_per_migration 每迁移独立事务，支持迁移内分批提交）
SciLit Oncology — 肿瘤科文献管理平台
快速启动
# 1. 启动所有服务
docker compose up -d
# 2. 初始化数据库（首次）
docker compose exec backend alembic upgrade head
# 3. 访问
# 前端: http://localhost:5173
# 后端 API: http://localhost:8000/docs
# MinIO 控制台: http://localhost:9001 (minioadmin/minioadmin)
项目结构
backend/
├── app/
│ ├── main.py # FastAPI 入口
│ ├── config.py # 配置
│ ├── db.py # 数据库连接
│ ├── core/ # 核心：安全、权限、多租户中间件
│ ├── models/ # SQLAlchemy 模型 (32 张表)
│ ├── schemas/ # Pydantic 请求/响应
│ ├── api/v1/ # REST API 端点
│ └── tasks/ # ARQ 异步任务 (PubMed 管道)
├── alembic/ # 数据库迁移
└── config/specialties/ # 科室配置 (oncology.yaml)
frontend/
├── src/
│ ├── views/public/ # 公开页面 (无需登录)
│ ├── views/auth/ # 登录/注册
│ ├── views/app/ # 已登录应用页面
│ ├── stores/ # Pinia 状态管理
│ ├── api/ # Axios 封装
│ └── router/ # Vue Router
docs/ # 完整设计文档 (9 份)
技术栈
- 后端: FastAPI + SQLAlchemy 2.0 (async) + PostgreSQL 16 + Redis + Elasticsearch
- 前端: Vue 3 + Naive UI + Pinia + Vite
- 任务队列: ARQ
- 文件存储: MinIO / S3
- 多租户: PostgreSQL RLS + ContextVar 双层隔离
文档
详细的产品规划、数据库设计、标签体系、数据管道、UI 设计见 docs/ 目录。